La puissance de l’ADN végétal au service de la sécurité et de la traçabilité.
Les agrumes, fruits colorés et parfumés, sont très prisés dans l’industrie de la cosmétique, de la parfumerie et de l’agroalimentaire. Connus depuis des centaines d’années, ils sont regroupés en 3 genres principaux (Citrus, Fortunella et Poncitrus) au sein de la famille des Rutacées1.
La classification des espèces au sein de cette famille reste compliquée. Avec l’étude des génomes nucléaires et chloroplastiques des plantes, de nombreuses équipes de scientifiques ont eu pour objectif d’établir de nouvelles classifications 2–6.
En plus des très communs citrons, oranges et mandarines, certaines espèces peu répandues sont utilisées dans la cuisine gastronomique telle que le citron caviar7. Avec la rareté, vient le prix élevé de ce type de produit et donc le risque de fraude.
L’équipe de DNA Gensee s’est lancée dans un programme de recherche sur ce sujet en lien avecde récentes études8–11 génétiques et grâce à l’aide de Bénédicte et Michel Bachès*, passionnés par les agrumes. Ce projet cible l’ADN des agrumes.
L’identification desagrumes à la fois dans les matières premières et dans les produits à base d’agrumes est primordiale pour assurer l’authenticité et prévenir le risque de fraude. En effet, rien ne ressemble plus à une poudre de plantes qu’une autre poudre de plantes.
Notre but est de pouvoir distinguer et authentifier les différentes espèces voire les sous-espèces d’agrumes, grâce aux technologies de barcoding et de metabarcoding.
*Pépinières Bachès – Agrumes-Oliviers, Mas Bachès – 66500 EUS
Références :
1. Une classification complexe – Pépinière Bachès – Agrumes et Oliviers. Available at: http://site.plantes-web.fr/baches/1285/une_classification_complexe.htm. (Accessed: 3rd January 2018)
2. Belknap, W. R. et al. Characterizing the citrus cultivar Carrizo genome through 454 shotgun sequencing. Genome 54, 1005–1015 (2011).
3. Carbonell-Caballero, J. et al. A Phylogenetic Analysis of 34 Chloroplast Genomes Elucidates the Relationships between Wild and Domestic Species within the Genus Citrus. Mol. Biol. Evol. 32, 2015–2035 (2015).
4. Garcia-Lor, A. et al. A nuclear phylogenetic analysis: SNPs, indels and SSRs deliver new insights into the relationships in the ‘true citrus fruit trees’ group (Citrinae, Rutaceae) and the origin of cultivated species. Ann. Bot. 111, 1–19 (2013).
5. Oueslati, A. et al. Genotyping by sequencing reveals the interspecific C. maxima / C. reticulata admixture along the genomes of modern citrus varieties of mandarins, tangors, tangelos, orangelos and grapefruits. PLoS ONE 12, (2017).
6. Curk, F. Citrus investigation : origines et diversité des citrons. (2016).
7. Bachès, B. & Bachès, M. Agrumes: comment les choisir et les cultiver facilement. (Ulmer, 2011).
8. Khamis, F. M. et al. DNA Barcode Reference Library for the African Citrus Triozid, Trioza erytreae (Hemiptera: Triozidae): Vector of African Citrus Greening. J. Econ. Entomol. 110, 2637–2646 (2017).
9. Mahadani, P. & Ghosh, S. K. Utility of indels for species-level identification of a biologically complex plant group: a study with intergenic spacer in Citrus. Mol. Biol. Rep. 41, 7217–7222 (2014).
10. Benson, D. A., Karsch-Mizrachi, I., Lipman, D. J., Ostell, J. & Sayers, E. W. GenBank. Nucleic Acids Res. 37, D26-31 (2009).
11. Luo, K. et al. Assessment of candidate plant DNA barcodes using the Rutaceae family. Sci. China Life Sci. 53, 701–708 (2010).
